在学校党委的周密部署下，期刊社认真学习习近平总书记对防控新冠肺炎疫情系列重要指示，结合党中央和教育部有关文件精神，认真落实学校防控指挥部要求，坚决履行疫情防控主体责任，保障期刊出版工作有序开展。
期刊社设立管理领导小组，制定《期刊社开学疫情防控工作细化方案》，倡议全社职工把行动统一到党中央关于疫情防控的决策部署上来。按学校要求，为减少人员聚集，严格实行弹性上班制度，各刊编辑室安排一名工作人员到岗值守，其余人员通过电话、微信、QQ等方式，居家办公，在线畅通，保证期刊编校工作正常运行。办公室做好信息搜集报送工作，严格执行每日“零报告”制度，做到情况清、底数明、数字准；落实到岗值守人员的防护措施，每日对办公室进行环境消毒。
期刊社发挥学术出版优势，在疫情防控初期就鼓励各刊结合学科特点，拟设疫情防控专题，组织专家学者开展科学研究，迅速推进组约稿的编校工作，助力疫情防控阻击战。经过紧张筹备，《西南大学报学报（自科版）》在2020年第3期组织专稿6篇，特设“新型冠状病毒研究”专栏，刊发学校科研人员参与相关研究的系列科研成果，涵盖抗病毒药物解析与药学监护、流行病学分析与临床特征及其治疗措施、检测诊断与心理干预等诸多方面，稿件已在中国知网进行网络首发。《教师教育学报》在第2期调整版面，以“疫情与教育”为主题，呼吁教育研究者站在时代前沿，积极思考重大疫情给教育提出的难题，尤其是带来教师教育及教师专业发展的思考。该期刊物即将刊发1篇讨论疫情对大学生心理影响的专题论文，以及一组七篇由特邀专家撰写的论文。《西南大学报学报》（社科版）也在教育学、心理学、法学、社会学、历史学和文学诸领域积极组约专家稿件，并收到《瘟疫后的自然-社会伦理重建——加缪<鼠疫>的现实启示》等论文，拟在第三期刊发。
当前疫情防控取得良好态势下，期刊社也发出《关于疫情防控延期开学期间实行线上办公的通知》，要求全体编辑在线处理编校工作；开通网上缴费平台，提高稿件处理速度；全面测评业务办公管理系统，推进办公智能化工作。另外，期刊社还在假期开发了基于投稿系统的网刊发布平台，全面升级线上投稿系统，搭建期刊集群网页，以方便期刊引用数据的统一管理。以上措施有力地保障了防疫期间停工不停刊的目标。