资源昆虫高效养殖与利用全国重点实验室	国家柑桔工程技术研究中心
重庆市三峡库区生态环境与生物资源省部共建国家重点实验室培育基地

认知与人格教育部重点实验室	三峡库区生态环境教育部重点实验室（共建）
发光与实时分析化学教育部重点实验室	淡水鱼类资源与生殖发育教育部重点实验室
南方山地园艺学教育部重点实验室	农业部蚕桑功能基因组与生物技术重点实验室
农业部西南作物遗传改良与育种重点开放实验室	农业部西南耕地保育重点实验室
农业部农产品贮藏保鲜质量安全风险评估实验室（重庆）	农业部柑桔产品质量安全风险评估实验室（重庆）

蚕桑资源及分子改良教育部工程研究中心	柑桔教育部工程研究中心
南方山地农业教育部工程研究中心

水产科学重庆市重点实验室	蚕桑学重庆市重点实验室
昆虫学及害虫控制工程重庆市重点实验室	生化医学分析重庆市重点实验室
柑桔学重庆市重点实验室	转基因植物与安全控制重庆市重点实验室
洁净能源材料与技术重庆市重点实验室	土壤多尺度界面过程与调控重庆市重点实验室
能源生物资源开发重庆市重点实验室	非线性电路与智能信息处理重庆市重点实验室
蚕桑基因组与生物技术工程实验室	淡水鱼类新品种繁育工程实验室
智能传动和控制工程实验室	重庆市油菜工程技术研究中心
重庆市柑桔工程技术研究中心（共建）	重庆市智能仪表及控制装备工程技术研究中心（共建）
重庆市马铃薯工程技术研究中心（共建）	重庆市特色食品工程技术研究中心
重庆市甘薯工程技术研究中心	重庆市兽药工程技术研究中心
重庆市花卉工程技术研究中心	三峡库区农业面源污染控制工程技术研究中心
重庆市药效评价工程技术研究中心（共建）	重庆市草食动物资源保护与利用工程技术研究中心
重庆市农业技术创新方法工程技术研究中心	重庆市药物过程与质量控制工程技术研究中心
重庆市农业农村信息化工程技术研究中心	重庆市蚕丝纤维新材料工程技术研究中心
重庆市生物质纤维材料与现代纺织工程技术研究中心	重庆市农业生物工程技术研究中心
疾病快速诊疗重庆市工程研究中心	重庆市蚕丝生物材料与再生医学工程技术研究中心

重庆柑橘国家野外科学观测研究站	农业部重庆紫色土生态环境重点野外科学观测试验站
农业部作物基因资源与种质创制重庆科学观测实验站	农业部西南地区果树科学观测实验站
国家柑桔苗木脱毒中心	国家柑橘加工技术研发专业分中心
重庆市柑桔危险性有害生物检测鉴定中心	农业部柑桔及苗木质量安全监督检验中心
国家柑桔品种改良中心	国家柑桔资源圃（重庆）
农业部魔芋研究中心	国家桑树品种改良中心重庆分中心
重庆市合川区国家级农作物品种审定区域试验站	国家蚕桑产业技术研发中心
三峡库区土地利用－重庆涪陵野外基地（国土资源部）	岩溶生态环境-重庆南川野外基地（国土资源部）

重庆烟草科学研究所	重庆市洁净能源与先进材料研究院
中国农科院柑桔研究所

柑桔研究所	蚕学与系统生物学研究所
生物技术中心	洁净能源与先进材料研究院
农业科学研究院	前沿交叉学科研究院生物学研究中心
医学研究院