题 目：新型结构RNA的发现、功能机制与潜在应用
时 间：2025年4月13日（星期日）9:00
主讲人：杨建华
地 点：弘朴楼（第37教学楼）207
主办单位：农学与生物科技学院
主讲人简介：杨建华，中山大学生命科学学院教授，长期致力于开发新的RNA组学实验方法和信息学方法寻找新类型RNA及其调控功能与作用机制。自主开发RIP-PEN-seq, PEN-seq, RIP-PENSHAPE-MaP, NAP-seq, NAP-SHAPE-MaP和Nm-REP-seq等测序技术和开发了包括starBase、kturnSeeker、snoSeeker、napSeeker等软件和平台被引用超过18000次（Google Scholar）。
讲座简介：
RNA除了用来合成蛋白质的遗传密码之外，还嵌入了第二层遗传信息—即RNA高级结构和序列基序。因此，揭示具有特定结构和序列基序的新类型非编码RNA（ncRNA）及其功能机制是理解细胞遗传信息传递的核心任务之一。我们开发了RIP-PEN-seq等新技术测定人和小鼠中与15.5K蛋白互作的全长ncRNA分子，发现了具有规律性后向K-turn结构基序的新类型的ncRNA分子—bktRNA。进一步结合多学科交叉技术，发现新鉴定的bktRNA1基因能够靶向剪接体里的U12基因，并对靶向基因进行特定位置的甲基化修饰。此外，通过结合多种实验和计算分析发现bktRNA1的缺失导致剪接体的ZCRB1基因不能与U12基因互作，从而引起U12类型内含子的剪接全局失调。这些结果表明由bktRNA1介导的靶向基因的甲基化修饰对U12型剪接体组装和内含子的加工是必不可少的。该研究通过开发多种新实验方法和计算机算法系统发现了具有三级K-turn结构和序列基序的新类型bktRNA，揭示了由bktRNA、RNA甲基化修饰和RNA剪接体的相互作用（crosstalk）形成的新层次基因表达调控机制。最近，我们还开发NAP-seq测序技术去鉴定各种长度的没有帽子的RNA（noncapped RNA, napRNA），发现了多类新的结构型ncRNA及成百上千起源于重复元件的新结构型ncRNA。重要的是，我们发现一个box C/D-H/ACA嵌合分子DINAP与假尿嘧啶合成酶DKC1相互作用，通过维持DKC1蛋白的稳定性来促进细胞增殖。综上，我们研究建立了发现具有潜在调控功能的各种长度结构型非编码RNA的方法和研究范式。
